La OCE en Panamá prioriza la mejora de las condiciones de vida de la población más vulnerable en la Comarca Emberá-Wounaan especialmente aquella que vive en áreas rurales e indígenas, incluyendo población migrante en tránsito. Se han formulado un proyecto con la Organización Panamericana de la Salud, y otro con la ONG HIAS para la mejora del acceso y cobertura de los actuales servicios de salud en la provincia del Darién.